隨著第三代基因測序技術的引入，生物信息學的研究領域得以廣泛拓展，為深度挖掘基因信息提供了更多的可能性，同時，也帶來了海量的數(shù)據(jù)分析和處理任務。

北京希望組生物科技有限公司（下文簡稱希望組）在打造全新的三代測序項目交付平臺時，引用火山引擎 Bio-OS 解決方案，建立了基于 web 的生信數(shù)據(jù)分析平臺，不僅有效降低生信數(shù)據(jù)分析門檻，也使售后人力成本降低了40%，運維成本降低了30%。

希望組（Grandomics）是全球知名的三代測序技術拓展者，也是中國首家三代測序服務公司。多年來，一直專注于在三代測序平臺上進行技術開發(fā)與應用拓展，其自主開發(fā)了基因組變異分析系統(tǒng)、單細胞測序技術等多項三代測序軟件和技術，并構建了三代測序高性能計算集群，為客戶提供優(yōu)質(zhì)的第三代測序分析和存儲服務。

圖片來源：希望組（Grandomics）官網(wǎng)

第三代測序發(fā)展迅速，底層調(diào)度迎來挑戰(zhàn)

近年來，第三代測序技術迅速發(fā)展，為基因組研究提供了高分辨率的數(shù)據(jù)。希望組致力于打造一個三代測序項目交付平臺，通過可視化界面幫助用戶進行生信數(shù)據(jù)分析，降低難度、提高效率。然而，生信數(shù)據(jù)分析流程復雜，計算任務多且波動大，需要處理海量非結構化文件數(shù)據(jù)。因此，希望通過異構集群納管調(diào)度能力，實現(xiàn)資源復用，降低成本，提升集群擴容的便利性。

火山引擎Bio-OS，助力生信數(shù)據(jù)分析

生信數(shù)據(jù)分析平臺

在火山引擎 Bio-OS 解決方案的支持下，希望組成功構建了基于 web 的生信數(shù)據(jù)分析平臺。該平臺不僅能夠充分利用現(xiàn)有的本地計算資源進行生信計算，同時也方便其客戶通過 web 頁面提交自己所需的生信分析流程來獲取分析結果。該平臺擁有無縫集成彈性容器、海量實例快速秒級啟動、靈活應對計算高峰等特性。此外，這些特性的引入也有效地縮減了售后支持方面的人力成本。

生信數(shù)據(jù)分析平臺的三大優(yōu)勢：

降本增效，資源利用：希望組引入 Bio-OS 方案，通過將本地的 SGE 集群納入私有集群的管理范圍，將舊有的計算資源轉化為有價值的資源，進一步提升計算效率，減少資源浪費，降低維護成本。

流程簡化，操作追溯：Bio-OS 通過在工作流中預置一系列分析步驟，希望組成功降低了生物信息學數(shù)據(jù)分析的門檻。實驗人員和醫(yī)生等非專業(yè)人士也能夠輕松地啟動復雜的數(shù)據(jù)分析流程，不需要深入了解技術細節(jié)。同時，通過 git 管理工作流的不同版本，確保了操作的可追溯性和回顧性。

容器集群，智能管理：在計算資源管理方面，火山引擎的 Bio-OS 方案引入了彈性容器，使系統(tǒng)能夠快速啟動和停止計算實例，以適應計算任務的變化。特別是在處理計算高峰時，依然能夠保證系統(tǒng)高效運行，不會因為負載增加而陷入延遲。

售后成本降低40%，運維成本降低30%

生信數(shù)據(jù)分析平臺，有效降低了生信數(shù)據(jù)分析的門檻，讓普通人員也可輕松開啟數(shù)據(jù)分析之旅。另外，Bio-OS 納管本地 SGE 集群的功能實現(xiàn)本地算力的充分利用，在提升集群管理效率的同時，降低了40%售后支持人力成本和30%運維成本。

目前，希望組在 Bio-OS 平臺集成的 notebook 工具基礎上，還開發(fā)了諸如花瓣圖、動態(tài)火山圖、單細胞基因表達降維圖、單細胞降維分群圖工具等。隨著技術的不斷演進，基因測序和 Bio-OS 的結合，將擴展我們對基因組含義和應用的理解，并創(chuàng)造出更多的發(fā)展機遇。

END

日前，火山引擎與基因會等六家生信領域企業(yè)，共同發(fā)布了《2023基因行業(yè)藍皮書》。未來，火山引擎將持續(xù)為科技研發(fā)提供支持，為生物信息領域的創(chuàng)新發(fā)展注入更多的動力。

更多詳細內(nèi)容，請點擊閱讀原文，下載《2023基因行業(yè)藍皮書》。

閱讀原文鏈接：
https://www.volcengine.com/docs/6624/1109238